Dos cosas ibizar:
¿Cómo puede ser que la termocupla1, empieze marcando una temperatura superior a la T2? Debería haber una diferencia de unos 20 grados entre el T2(preheater) y T1(Top). Tu curva empieza precalentando mas por la parte superior que por la parte inferior de la placa base, no lo entiendo.
Otra cosa, en el caso de que tu Hotgun sea tan potente, deberías regularlo con un dimer, esto parece mas que un HotGun, un "LANZALLAMAS".
Si te fijas en esta curva
la diferencias de temperatura entre Hotgun y Preheater, puede ser que tu T1 no funcione correctamente, asegúrate de que los metales de la termocupla no estén en corto. Si tienes algún medidor externo, prueba-lo y contrasta temperaturas.
Lo de meter pulsos, es normal, existe inercia térmica, al igual que si metes un pulso de 1s se dispara, si paro 1s bajaría la temperatura, los pulsos en mínima potencia son de 100ms, así que no te preocupes por eso.
Ya nos cuentas.
Saludos.